study of the effect of increasing markers density on the accuracy of genomic evaluation using rrblup

[ ' g e n o m i c s e l e c t i o n i s a m e t h o d t o p r e d i c t t h e b r e e d i n g v a l u e s o f i n d i v i d u a l s u s i n g a l a r g e n u m b e r o f s i n g l e n u c l e o t i d e p o l y m o r p h i s m m a r k e r s . t h e c o s t o f t h e h i g h ' , ' d e n s i t y m a r k e r p a n e l g e n o t y p i n g i s v e r y h i g h ' , ' w h i c h p r e v e n t s t h e w i d e l y a p p l i c a t i o n o f g e n o m i c s e l e c t i o n . t h e p r e s e n t s i m u l a t i o n s t u d y w a s c a r r i e d o u t t o e v a l u a t e t h e u s e o f l o w t o m e d i u m m a r k e r d e n s i t y p a n e l s t o p r e d i c t d i r e c t g e n o m i c v a l u e s . i n t h i s s t u d y ' , ' a t r a i t w i t h h e r i t a b i l i t y o f 0 . 1 0 ' , ' 0 . 2 0 ' , ' a n d 0 . 4 0 w a s s i m u l a t e d . t h e s i m u l a t e d g e n o m e w a s c o n s i s t e d o f 2 5 o u t o s o m e s w i t h t h e s a m e d i s t a n c e ( 1 m o r g a n ) . d i f f e r e n t m a r k e r d e n s i t y ( 1 2 . 5 ' , ' 2 7 . 5 a n d 5 0 k ) a n d 1 2 5 ' , 2 5 0 , ' 5 0 0 a n d 1 0 0 0 r a n d o m d i s t r i b u t e d q t l w e r e s i m u l a t e d . t h e l e a s t s q u a r e m e a n s o f g e n o m i c a c c u r a c y v a r i e d b e t w e e n t h e d i f f e r e n t l e v e l s o f h e r i t a b i l i t y a n d t h e d i f f e r e n t m a r k e r d e n s i t y ( p ' ]